追記（これから Customize UI 拡張機能を使いたい人へ）:

VSCode 側の修正により、Customize UI 側から VSCode の UI 変更に関わる API アクセスが大幅に制限されたため、拡張機能自体がほぼ使用不可となっているため、Customize UI ユーザーは「強制的に拡張機能が無効化されてしまった」という事態となってしまいました。
https://github.com/iocave/customize-ui/issues/156

現在、本記事に基づいて拡張機能を導入すると、VSCode が起動しなくなりますのでご注意を。
既存ユーザは、以下のコマンドで一時的に拡張機能を無効化した上で起動後、Customize UI をアンインストールすることで起動しなくなる問題は回避できます。

$ code --disable-extension
または
$ code --disable-extension iocave.customize-ui

やりたい事

Visual Studio Code を自分好みにカスタマイズしたい。

具体的には、テーマや設定では変更出来ないような:

システムフォントを好きなフォントに変更したい
UI 自体の細かなスタイルの調整をしたい

VSCode 自体は Electron なので、インストールされたパッケージを直接弄って好みのデザインに調整しようと思えば可能。
しかしそれもアップデートによって毎回元に戻ってしまうので面倒。

※ 変更前

Customize UI (拡張機能) とは

Customize UI - Visual Studio Marketplace

VSCode の UI を設定の範疇を超えてカスタマイズ出来る拡張機能のこと。

具体的には:

システムフォントの変更
- 等幅フォントと通常フォントをそれぞれ変更
- フォントサイズの調整
アクティビティバーの表示位置の変更（左側から下部へ）
タイトルバーをインラインにする（macOS のみ）
ファイルツリーの項目の高さの変更
カスタムスタイルの設定

なお、同制作者が作った JavaScript のインジェクションを行う Monkey Patch に依存しているため、両方インストールされる。

変更後

タイトルバーがスッキリして、コードの可視領域も広がっている。
以降は Customize UI で行った設定変更と微調整したスタイルを紹介する。

システムフォントの変更

以下の設定を変更する。

customizeUI.font.regular: システム UI の通常フォント
customizeUI.font.monospace: システム UI 中のコード表示に使われる等幅フォント

個人的に UI に丸ゴシック（ヒラギノ丸ゴ）を設定したかったので:

{
  "customizeUI.font.regular": "HiraMaruProN-W4",
  "customizeUI.font.monospace": "Cascadia Code"
}

タイトルバーとアクティビティバーの変更

customizeUI.titleBar と customizeUI.activityBar で変更する。

{
  "customizeUI.titleBar": "inline", // macOS のみ
  "customizeUI.activityBar": "bottom"
}

タイトルバーとタブバーの位置を揃えることが出来るので、画面がスッキリする。
ただしアクティビティバーは、拡張機能を多くインストールしているとオーバーフローして表示されるため使い勝手が悪くなるかも。

ファイルツリーの項目の高さの変更

customizeUI.listRowHeight で変更出来る。

{
  "customizeUI.listRowHeight": 27
}

27ピクセルの高さに調整される（ただしアイコンの高さが補正されないので、後述のカスタムスタイルで調整する必要がある）。

カスタムスタイルの設定

VSCode 上のスタイルクラスを指定し、既存のスタイルを上書きするような設定を記述出来る。

{
  "customizeUI.stylesheet": {
    "selector": "style"
  }
}

以降はカスタムスタイルで設定した微調整の設定例を紹介する。

リストアイコンの位置調整例

リストの高さと同じぐらいに調整すればきれいに表示される。

{
  "customizeUI.stylesheet": {
    ".show-file-icons .folder-icon::before": "height: 26px",
    ".show-file-icons .file-icon::before": "height: 26px"
  }
}

コマンドパレットのフォントサイズ調整例

{
  "customizeUI.stylesheet": {
    ".monaco-list-rows": "font-size: 12.5px",
    ".monaco-tree-wrapper": "font-size: 12.5px"
  }
}

パンくずリストとシェル選択コンボボックスの微調整

フォントサイズか要素の高さを変えることで不格好さをなくす。

{
  "customizeUI.stylesheet": {
    ".monaco-select-box": "height: 23px",
    ".monaco-breadcrumbs": "font-size: 11.5px"
  }
}

Customize UI 拡張機能を使ったお気楽 VSCode UI Tweak - macOS での設定例の紹介-