最新の pleiades だと最初から、Eclipse_4.6 Neon だと Spring 系プラグインを入れたら、GitBucket からインポートするときに ssh が Algorithm negotiation fail で使えなってしまいました。対処がわかったのでメモ残しておきます。
ssh のパスを確認
$which ssh
/usr/bin/ssh
環境変数に GIT_SSH を追加
$vi .bash_profile
export GIT_SSH=/usr/bin/ssh
暗号の種類追加
$vi /etc/ssh/sshd_config
# AuthorizedKeysFile の次くらい（適当）に以下の行を追加
KexAlgorithms curve25519-sha256@libssh.org,ecdh-sha2-nistp256,ecdh-sha2-nistp384,ecdh-sha2-nistp521,diffie-hellman-group-exchange-sha256,diffie-hellman-group14-sha1,diffie-hellman-group-exchange-sha1,diffie-hellman-group1-sha1
設定を反映
$source ~/.bash_profile
sshd を再起動
$sudo launchctl stop com.openssh.sshd
$sudo launchctl start com.openssh.sshd
Eclipse clean 起動
$[Eclipseインストールディレクトリ]/Eclipse_4.6.3.app/Contents/MacOS/eclipse -clean
これで、ssh チェックアウトできました。